Nejstarší dochovaný rukopis J. A. Komenského z roku 1611.  Část textu česky: V mladosti má člověk pamatovati, kterak by dobře živ byl, a v starosti kterak by dobře umřel.

V roce 1628 odešel do exilu do polského Lešna, které se stalo centrem bratrské víry. Zpočátku doufá, že se brzy vrátí zpět do vlasti, proto píše česky. Začal psát učebnice a připravoval plán na zlepšení organizace školství, např. v díle Navržení krátké o obnově škol v Království českém. V Lešně byl zvolen biskupem a písařem, brzy se stal i zástupcem rektora gymnázia, což vedlo k jeho zájmu o pedagogiku. V tomto období vznikla velká část jeho děl, především pak z oblasti pedagogiky jako např. Česká didaktika. Ta měla být původně součástí velkého díla, které chtěl nazvat Ráj český. Obsahem měla být teoretická, didaktická a praktická část, která by sloužila rodičům a učitelům. Napsal Velkou didaktiku, kterou později přepracoval do latinské podoby Didactica magna a začíná pracovat na Vševědě (Pansofii). Komenskému postupně jeho díla jako Brána jazyků otevřená a Informatorium školy mateřské, zajistila věhlas po celé nekatolické Evropě. Byl zván na univerzity několika zemí, nabídky však odmítal. První významnou nabídku Jan přijal až roku 1641, kdy se rozhodl vyhovět pozvání anglického parlamentu na přednáškové turné, během něhož vystoupil i před Královskou akademií věd. V této době vyjádřil své myšlenky ve spise Via lucis. Kvůli zvyšujícímu se tlaku občanské války Komenský Anglii opustil, avšak zanedlouho dostal pozvání z řady dalších zemí. V tuto dobu si Jan uvědomil, že právě prostřednictvím těchto nabídek, může rozšířit svůj vliv a své myšlenky.

Roku 1642 odešel přes Amsterdam do Švédska, kam byl pozván, aby vedl reformu tamního školství a napsal pro ní učebnice. Vznikl zde spis Nejnovější metoda jazyků. Kvůli rozporům s donátory i spolupracovníky, nakonec učebnice požadované švédským kancléřem Komenský neuvytvořil a to ani na nátlak ochránce Louise de Geera. Zato zde vzniká část Obecné porady o nápravě věcí lidských. Roku 1648 se společně s těžce nemocnou manželkou vrátil zpět do Lešna, kde působí jako biskup. V Lešně jeho druhá žena zemřela a již o rok později se oženil potřetí, tentokrát s o více než třicet let mladší Janou Gajusovou. Když byl v roce 1648 uzavřen vestfálský mír a tím skončila třicetiletá válka, skončily též naděje českých exulantů na návrat do vlasti. Komenský se loučí s vlastí a církví spisem Kšaft umírající matky jednoty bratrské.

72 jmen české historie Dějiny udatného českého národa Historický magazín Komenského mapy Muzeum v Přerově Nepohodlní Putování Jana Amose Staleté kořeny	Diogenes znovu naživu Labyrint světa a ráj srdce Labyrint světa a ráj srdce - četba Učitel národů Úžasné životy	Cesta světla z roku 1920 Didactica magna z roku 1913 Haggaeus redivivus Historie o těžkých protivenstvích církve české Hlubina bezpečnosti Hlubina bezpečnosti z roku 1864 Jak zahnati lenost ze škol Kšaft umírající matky Jednoty bratrské z roku 1879 Labyrint světa a ráj srdce Labyrint světa a ráj srdce z roku 1862 Labyrinty - brožura Muzea Jana Amose Komenskeho v Přerově Listové do nebe Nedobytedlný hrad Jméno Hospodinovo O sirobě Orbis Pictus z roku 1883 Přemyšlování o dokonalosti křestanské Přemyšlování o dokonalosti křesťanské z roku 1918 Smutný hlas Stručná historie církve slovanské Truchlivý Truchlivý z roku 1622 Via Lucis Zpráva a naučení o kazatelství